みやざきフェニックス・リーグに参戦している四国・九州アイランドリーグ選抜は15日、湘南（横浜２軍）と対戦した。リーグ選抜は２回に１点を先制したが、中盤に逆転を許す。８回に中村真崇（福岡）のタイムリーで１点を返したものの、以降は反撃できず、２−５で敗れた。リーグ選抜は、この試合からメンバーを入れ替え、香川・西田真二監督が指揮を執ったが、成績は３勝４敗（練習試合含む）と１つの負け越しとなった。16日は西都で千葉ロッテと試合を行う。
みやざきフェニックス・リーグに参戦している四国・九州アイランドリーグ選抜は13日、東北楽天と対戦した。リーグ選抜は３回に檜垣浩太（愛媛）のタイムリーで１点を先制したが、中盤に逆転を許す。６回には連打で２点を返したものの、以降は反撃できず、３−５で敗れた。リーグ選抜は練習試合を含め、３勝３敗で第１クールを終え、15日の湘南戦（ひむかスタジアム）からは香川・西田真二監督が指揮を執る。
みやざきフェニックス・リーグに参戦している四国・九州アイランドリーグ選抜は12日、NPBの混成チームであるフューチャーズと対戦した。リーグ選抜は初回に１点を先制すると、３回にも笠井要一（香川）の２ランで得点を追加。６回と８回にはフューチャーズ３番手の金無英（福岡ソフトバンク、元福岡）からも計２点を奪う。投げては５人の投手陣で相手打線を無安打無得点に封じ、５−０で勝利した。フューチャーズでは他に千葉ロッテの宮本裕司（元高知）、生山裕人（元香川）も出場した。
みやざきフェニックス・リーグに参戦している四国・九州アイランドリーグ選抜は11日、北海道日本ハムと対戦した。リーグ選抜は２回、檜垣浩太（愛媛）のタイムリーなどで２点を先制。中田翔の２ランで追いつかれた４回には智勝（香川）の２打席連続タイムリーで勝ち越しに成功する。しかし、終盤に再び同点とされると、８回に鵜久森淳志のタイムリーを許したのをきっかけに４失点。３−８で敗れた。
みやざきフェニックス・リーグに参戦している四国・九州アイランドリーグ選抜チームが10日、東京ヤクルトと対戦した。リーグ選抜は３回、元香川の三輪正義にタイムリーを浴びて先制を許したが、直後に西本泰承（高知）のソロなどで逆転に成功。終盤に追いつかれたものの、８回に洋輔（香川）のソロで勝ち越し、３−２で勝利した。
四国・九州アイランドリーグは2010シーズンの入団選手採用を目的としたトライアウトを11月15日より高知、さいたま、茨木と福岡の４カ所で実施すると発表した。15歳以上（2010年４月１日現在）の男子で義務教育を修了している選手であれば、受験可能。今年より社会人野球を統括する日本野球連盟が、所属選手の異動をNPB同様、高卒は３シーズン、大卒は２シーズン(いずれも中退も含む）制限する方針を打ち出したため、該当する選手は受験しても選手契約を結べない。
四国・九州アイランドリーグ選抜チームが８日、NPB12球団などが参加する宮崎の秋季教育リーグ（みやざきフェニックス・リーグ）で埼玉西武と対戦した。台風の影響で２日間、試合が中止となり、この日が初戦となったリーグ選抜は序盤に前半に８点を失う苦しい展開。５回に末次峰明（長崎）のタイムリーなどで４点を返したが及ばず、６−９で敗れた。
四国・九州アイランドリーグは６日から宮崎で行われる秋季教育リーグ（みやざきフェニックス・リーグ）に出場するアイランドリーグ選抜チームの27選手を発表した。打撃２冠のカラバイヨ（高知）、セーブ王の角野雅俊（福岡）らほぼベストメンバーをそろえた。監督は徳島の堀江賢治監督が13日まで務め、15日からは香川・西田真二監督がチームの指揮を執る。これに伴って選手も入れ替えを実施する予定だ。
四国・九州アイランドリーグは３日、リーグチャンピオンシップ第３戦が長崎・佐世保市野球場で行われ、高知ファイティングドッグスが３−１で長崎セインツを破って、４年ぶり２回目の年間優勝に輝いた。今季の高知は後期に７期ぶりの優勝を果たし、前期覇者・長崎とのチャンピオンシップでは第１戦、第２戦と連勝。負けなしの３勝０敗でリーグの頂点に立った。高知は24日から、ＢＣリーグ王者と今年の独立リーグ日本一をかけ、グランドチャンピオンシップを戦う。
徳島インディゴソックスが28日、オリックス２軍と淡路佐野運動公園野球場で交流試合を行った。２軍調整中のグレッグ・ラロッカ、濱中治らが出場したオリックス打線に、徳島は３回に１点、４回にも３点を追加される苦しい展開。５回に山本剛士のタイムリーで１点を返したものの、直後に３点を失い、結局３−12で敗れた。オリックスでは６番手に梶本達哉（元愛媛）が９回のマウンドに上がり、１回無失点で最後を締めた。
◇９月27日（日） （高知２勝、高知、643人） 長崎セインツ ４ ＝ ０２０００１０１０ ００００００ （延長15回） 勝利投手 山隈（１勝０敗） 敗戦投手 石田（０勝１敗） 本塁打 （高）古卿２号３ラン、オ１号満塁
◇９月26日（土） （高知１勝、高知、627人） 長崎セインツ １ ＝ ００００１００００ 勝利投手 吉川（１勝０敗） 敗戦投手 酒井（０勝１敗） 本塁打 （高）古卿１号２ラン
四国・九州アイランドリーグは、最後に残っていた２試合を終了し、2009シーズン前後期の全日程を終了した。後期は高知が７期ぶりに優勝。香川は前後期とも２位に入ったものの無冠に終わり、４年連続の年間王者の夢を断たれた。前期優勝の長崎は後期は勝率５割で４位。徳島は昨年の後期から３期連続の最下位に沈んだ。2009年の年間王者をかけたリーグチャンピオンシップは長崎と高知による組み合わせで26日に高知球場（12時）で開幕する。
◇９月22日（火） （福岡６勝２敗、北九州、583人） 徳島インディゴソックス １ ＝ ０１０００００００ 勝利投手 森（14勝７敗） 敗戦投手 光安（５勝７敗） セーブ 角野（０勝３敗18Ｓ）
◇９月21日（月） （香川３勝４敗１分、サーパス、2,660人） 徳島インディゴソックス １ ＝ ００００００１００ 勝利投手 上野（４勝５敗２Ｓ） 敗戦投手 大川（２勝10敗）
四国・九州アイランドリーグは20日、首位の長崎セインツが２位の香川オリーブガイナーズを直接対決で下し、成績を21勝11敗６分として後期優勝を決めた。高知は2006年前期以来、７期ぶりのリーグ制覇。定岡智秋監督にとっては就任２年目で初めての優勝となった。高知はリーグ初年度（05年）以来の年間王者を目指し、９月26日からのリーグチャンピオンシップ（５試合制）で前期優勝の長崎セインツと対戦する。敗れた香川は今季、無冠に終わり、４年連続年間優勝の夢を断たれた。
四国・九州アイランドリーグは19日、首位の高知ファイティングドッグスが勝ち、２位・香川オリーブガイナーズとの1.5差をキープした。両チームの残り試合はともに３。20日に高知で行われる直接対決で高知が勝てば、２試合を残して2006年前期以来の優勝が決定する。引き分けの場合はマジック１が点灯する。
◇９月18日（金） （高知５勝１敗２分、坊っちゃん、2,872人） 愛媛マンダリンパイレーツ ０ ＝ ０００００００００ 勝利投手 山隈（３勝１敗１Ｓ） 敗戦投手 浦川（４勝７敗５Ｓ） セーブ 吉川（13勝５敗１Ｓ） 本塁打 （高）中村９号２ラン
◇９月16日（水） （福岡３勝４敗、鳥栖、82人） 長崎セインツ ０ ＝ ０００００００００ 勝利投手 渡邊（８勝８敗） 敗戦投手 藤岡（８勝６敗） セーブ 角野（０勝３敗17Ｓ） 本塁打 （福）國信３号ソロ、中村11号ソロ
高知ファイティングドッグスから2007年に千葉ロッテに入団した角中勝也外野手が15日、今季初の１軍出場選手登録を果たした。同日行われた埼玉西武戦（千葉マリン）では早速、９番・レフトで先発出場。５回の第２打席に３塁打を放って、一時は勝ち越しとなるホームを踏むなど、３打数１安打１四球の内容だった。試合はロッテが２−３で敗れた。
高知ファイティングドッグスは14日、５年ぶりに現役復帰し、８月に入団した元ヤンキース・伊良部秀輝投手との契約解除を発表した。故障で今シーズン中の登板が難しいため。今季、米独立リーグのロングビーチ・アーマダで現役復帰した伊良部は、NPBへの再挑戦を目指し、高知入りを決めた。アイランドリーグでは２試合に先発し、勝敗はつかず、防御率5.25の成績だった
◇９月13日（日） （香川６勝１敗１分、観音寺、1,076人） 愛媛マンダリンパイレーツ ６ ＝ ３０００２０１００ 勝利投手 上野（３勝５敗２Ｓ） 敗戦投手 篠原（２勝５敗１Ｓ） セーブ 橋本（５勝３敗11Ｓ） 本塁打 （愛）大津８号３ラン、近藤２号ソロ
◇９月12日（土） （高知５勝１敗１分、室戸、263人） 徳島インディゴソックス ０ ＝ ０００００００００ 勝利投手 山中（６勝７敗１Ｓ） 敗戦投手 平野（６勝９敗１Ｓ）
◇９月11日（金） （高知４勝１敗１分、高知、210人） 徳島インディゴソックス ０ ＝ ０００００００００ 勝利投手 吉川（12勝５敗） 敗戦投手 金子（４勝４敗） セーブ 伊代野（１勝２敗９Ｓ） 本塁打 （高）カラバイヨ17号ソロ、梶田４号ソロ
◇９月９日（水） （徳島２勝４敗１分、アグリあなん、570人） 香川オリーブガイナーズ ３ ＝ １００１１００００ 徳島インディゴソックス ３ ＝ ０２０００１１００ （９回引き分け） 本塁打 （香）金井９号ソロ
