10月１日（月） （石川16勝５敗１分、三条市民球場、人） 新潟アルビレックスＢＣ ２ ＝ ０１０１０００００ 勝利投手 蛇澤（13勝４敗） 敗戦投手 前田（０勝５敗） セーブ 高田（１勝２敗15Ｓ） 本塁打 （新）木ノ内３号ソロ
プロ野球パ・リーグは29日、優勝へのマジックを２としていた北海道日本ハムファイターズが、２位・千葉ロッテとの直接対決を制し、２年連続４回目（前身の東映時代を含む）のリーグ制覇を達成した。球団にとって連覇は初めて。パ・リーグでは99、00年の福岡ダイエー（現ソフトバンク）以来、７年ぶりの連覇となった。
四国アイランドリーグは30日、２試合を行い、シーズンの全日程を終了した。前後期とも優勝したのは香川オリーブガイナーズ。個人タイトルでは首位打者を愛媛のルーキー・比嘉将太が獲得し、最多勝も愛媛の新人・梶本達哉が香川・松尾晃雅とタイトルを分け合った。2007年の年間王者をかけたリーグチャンピオンシップは香川−愛媛の組み合わせで10月５日に開幕する。
９月30日（日） （新潟５勝15敗１分、悠久山球場、1,218人） 石川ミリオンスターズ ２ ＝ ００２００００００ 勝利投手 藤井（６勝11敗１Ｓ） 敗戦投手 高森（０勝３敗）
◇９月29日（土） （愛媛13勝２敗、坊っちゃんスタジアム、8,232人） 徳島インディゴソックス ０ ＝ ０００００００００ 勝利投手 梶本(15勝６敗１Ｓ) 敗戦投手 竹原(０勝５敗３Ｓ)
（富山18勝４敗、新潟市営鳥屋野野球場、2,489人） 新潟アルビレックスＢＣ ３ ＝ ００１１００１００ 勝利投手 生出（６勝４敗１Ｓ） 敗戦投手 矢野（３勝８敗） 本塁打 （富）野原12号ソロ （新）登石２号ソロ、頓所２号ソロ
四国アイランドリーグは28日、後期優勝へのマジックを２としていた香川オリーブガイナーズが、サーパススタジアム（高松）で行われた２位・愛媛マンダリンパイレーツとの直接対決を１−０で制し、昨年の後期から３期連続の優勝を決めた。
四国アイランドリーグは27日、首位・香川が徳島にダブルヘッダーで連勝し、２位・愛媛が高知に敗れた。この結果、香川に後期シーズン優勝マジック２が点灯した。香川は２位・愛媛との残り１試合の直接対決に敗れても、他の２試合に勝利すれば、27勝14敗４分。愛媛が全勝した場合の28勝16敗１分を勝率で上回り、他チームに自力優勝の可能性がなくなった。香川は28日の愛媛との直接対決（サーパススタジアム、18時試合開始）に勝てば、３期連続の優勝が決定する。
９月27日（木） （富山９勝11敗１分、アルペンスタジアム、2,128人） 石川ミリオンスターズ ４ ＝ ０２０１１００００ 勝利投手 五艘（３勝１敗３Ｓ） 敗戦投手 蛇澤（12勝４敗） セーブ 田中（２勝０敗６Ｓ）
26日、西武の石井貴投手とヤクルトの鈴木健内野手が今シーズン限りで現役を引退することを発表した。
◇９月26日（水） （香川９勝４敗１分、高知市営球場、259人） 高知ファイティングドッグス ４ ＝ １１２００００００ 勝利投手 亮寛(１勝２敗) 敗戦投手 野原(４勝３敗１Ｓ) セーブ 天野(７勝６敗11Ｓ) 本塁打 (香)ブライス２号満塁
９月24日（月） （石川11勝８敗１分、宮野野球場、1,363人） 富山サンダーバーズ ３ ＝ ０００００００３０ 勝利投手 都（８勝４敗１Ｓ） 敗戦投手 小園（９勝５敗） セーブ 高田（１勝２敗14Ｓ）
◇９月23日（日） （愛媛６勝７敗１分、サーパススタジアム、4,319人） 香川オリーブガイナーズ １ ＝ ０００１０００００ 勝利投手 浦川(９勝９敗６Ｓ) 敗戦投手 松尾(14勝３敗) ▼９月24日の試合は２カードともノーゲーム
９月23日（日） （信濃８勝12敗１分、諏訪湖スタジアム、1,157人） 石川ミリオンスターズ ０ ＝ ００００００ （降雨コールド） 勝利投手 佐藤(７勝５敗) 敗戦投手 高森(０勝２敗)
９月22日（土） （石川15勝４敗１分、石川県立野球場、1,588人） 新潟アルビレックスＢＣ ３ ＝ ０００００３０００ 勝利投手 都（７勝４敗１Ｓ） 敗戦投手 徳田（０勝３敗） セーブ 高田（１勝２敗12Ｓ） 本塁打 （新）根鈴８号３ラン
◇９月21日（金） （香川７勝４敗１分、サーパススタジアム、1,332人） 高知ファイティングドッグス ０ ＝ ０００００００００ 勝利投手 橋本(７勝２敗８Ｓ) 敗戦投手 山隈(６勝８敗４Ｓ) 本塁打 (香)国本６号ソロ
19日、佐々岡真司（広島）が今季限りで現役を引退することが明らかとなった。同日、佐々岡は球団に引退の申し出を行い、球団側もこれを了承した。来週中にも会見を開き、正式発表される見通しだ。
９月20日（木） （石川14勝４敗１分、三条市民球場、521人） 新潟アルビレックスＢＣ ０ ＝ ０００００００００ 勝利投手 蛇澤（12勝３敗） 敗戦投手 谷合（４勝６敗） セーブ 高田（１勝２敗12Ｓ）
東京ヤクルトスワローズの古田敦也選手兼監督が19日、正式に監督退任と現役引退を発表した。会見に臨んだ古田兼任監督は、監督退任、現役引退ともに「悔いはありません」と語っていたが、途中からは涙を流し、言葉に詰まる場面もあった。「寂しいという感じよりも、悔しい」。自身、チームともに今季は不本意な成績に終わり、最後は本音ものぞかせる退任発表となった。
IBLJは、現在、会社が直接保有している高知ファイティングドッグスの経営者を県内を含む全国から一般公募することを発表した。対象は個人、企業問わずに10月中旬ごろまで受け付けるが、見つからない場合は最悪、球団の活動を休止する可能性が出てきた。
18日、東京ヤクルトの古田敦也選手兼任監督が今季限りで現役を引退し、同時に監督も辞任する意向を球団に申し入れていることが明らかになった。 球団は専任監督として来季の続投を要請し慰留しているが、本人の決意が固いことから受け入れるとみられている。早ければ明日19日にも記者会見が行われる見通しだ。
18日、北信越ＢＣリーグは、来季のリーグ名称を「北信越ベースボール・チャレンジ・リーグ」から「ベースボール・チャレンジ・リーグ」に変更することを発表した。
◇９月17日（月） （愛媛５勝７敗１分、サーパススタジアム、1,537人） 香川オリーブガイナーズ ３ ＝ ０１０００１００１ 勝利投手 小山内(６勝８敗３Ｓ) 敗戦投手 亮寛(０勝２敗) セーブ 浦川(８勝９敗６Ｓ) 本塁打 (香)堂上６号ソロ
９月17日（月） （新潟４勝13敗１分、上越市営球場、2,095人） 石川ミリオンスターズ ６ ＝ ００４１１００００ 勝利投手 藤井（４勝11敗１Ｓ） 敗戦投手 木村（１勝２敗） 本塁打 （新）木ノ内２号ソロ
（富山16勝４敗、1,740人、小矢部野球場） 新潟アルビレックスＢＣ ２ ＝ ００１００１０００ 勝利投手 生出（４勝４敗１Ｓ） 敗戦投手 矢野（３勝７敗） 本塁打 （新）登石１号ソロ、小西２号ソロ （富）井野口７号３ラン、８号２ラン
