◇４月５日 ニッパツ三ツ沢球技場 3,244人
◇３月29日 ニンジニアスタジアム 4,540人 【得点】 [Ｃ大阪] 香川（67分）
◇３月25日 熊本県民総合運動公園陸上競技場 3,531人 【得点】 [熊本] 木島（67分） [愛媛] アライール（５分）
◇３月21日 ニンジニアスタジアム 3,048人 【得点】 [愛媛] 田中（43分、52分）、ジョジマール（89分）
◇３月15日 富山県総合運動公園陸上競技場 5,214人 【得点】 [愛媛] 赤井（１分）、内村（38分） [富山] 渡辺（66分）
◇３月８日 ニンジニアスタジアム 4,018人 【得点】 [愛媛] 内村（35分、79分）、田中（74分） [水戸] 中村（13分）
愛媛FCにとって４年目のＪがスタートする。今季から栃木ＳＣ、カターレ富山、ファジアーノ岡山の３クラブが加わり、Ｊ２は各クラブ３戦総当りの計51試合制となる。昨季は６位以上を目標に掲げながら、参入後、ワーストの14位に終わった。「サポーターに謝ってばかりだった。今年は笑顔の１年にしたい」と語るDF金守智哉を筆頭に昨年の悔しさを晴らそうとの思いはクラブ全体が共有している。
愛媛FCはブラジル人DFのアライールの加入を発表した。アライールは01年に清水エスパルス入り。02年にヴァンフォーレ甲府へレンタル移籍し、03年より完全移籍した。サイドバックとして05年の甲府のＪ１昇格に貢献。Ｊ２通算106試合４ゴール。07年からは母国のブラジルやイングランドでプレーしていた。愛媛には２月の鹿児島キャンプからチームに合流。選手層の薄い愛媛にとっては、貴重な戦力となりそうだ。
2009年のＪ２試合日程が６日、発表された。 昨季14位と低迷し、巻き返しを図る愛媛は２年連続のホームでの開幕。３月８日（13時30分キックオフ）、水戸ホーリーホックと対戦する。続く第２節では新規参入のカターレ富山のホーム開幕戦に乗り込む。徳島ヴォルティスとの四国ダービー初戦は第10節（４月25日14時キックオフ）、ホーム・ニンジニアスタジアムで行われる。
愛媛FCはヴァンフォーレ甲府よりFWジョジマールを完全移籍で獲得すると発表した。ジョジマールは2007シーズン途中より、愛媛に期限付き移籍。昨季は甲府に戻って、４月の愛媛戦で決勝ゴールを決めるなど、13試合で５ゴールをあげていた。愛媛には２年ぶりの復帰となる。
愛媛FCは、大分トリニータから期限付き移籍で2007シーズンより在籍していたMF内村圭宏を完全移籍で獲得すると発表した。内村は所属していた大分より、来季の契約を結ばない旨を通告されており、移籍の交渉が進んでいた。
ヴィッセル神戸から期限付き移籍で所属していたMFキム・テヨンが期間満了につき、退団することが決まった。キムはボランチのポジションで主に第２クールまで27試合に出場した。キムは来季、神戸に戻らず、今度は水戸ホーリーホックに移籍する。
シーズンが終了し、愛媛FCでは来季にむけて選手の加入、退団が続々と決まっている。昨季、浦和レッズから期限付き移籍でプレーしていたMF大山俊輔（湘南）を完全移籍で獲得。一方で今季、期限付き移籍で所属していた７選手のうち、４名は期間満了でチームを去ることになった。
◇12月６日 大阪長居スタジアム 16,186人 【得点】 [大阪] 酒本（63分）、カイオ（64分） [愛媛] 江後（50分）
◇11月30日 ニンジニアスタジアム 5,792人 【得点】 [愛媛] 青野（10分、32分） [山形] 長谷川（12分）、石川（88分）、豊田（89分）
愛媛FCは28日、望月一仁監督の続投を発表した。望月監督はJFL時代の2005年より指揮を執り、来季は５年目のシーズンとなる。今季の愛媛はＪ昇格後、ワーストとなる12位以下が確定しており、シーズン前に掲げた６位以上の目標に遠く及ばなかった。特に得点数は36とリーグ最低。来季は攻撃の形を早い時期に構築することが課題になりそうだ。
◇11月23日 レベルファイブスタジアム 13,267人 【得点】 [福岡] 大久保（49分）、田中（52分） [愛媛] 横山（24分）、田中（76分）
◇11月８日 ニンジニアスタジアム 2,485人 【得点】 [熊本] 高橋（６分）
◇11月３日 さいたま市駒場スタジアム 16,724人 【得点】 [浦和] ポンテ（95分）
◇10月25日 ニッパツ三ツ沢球技場 3,739人 【得点】 [横浜] 御給（10分）、三浦知（55分） [愛媛] 大木（50分）、横谷（53分）
◇10月19日 ユアテックスタジアム宮城 13,118人 【得点】 [仙台] 平瀬（13分）
◇10月12日 ニンジニアスタジアム 1,569人 【得点】 [愛媛] 内村（42分）、大木（63分） [佐川] 平井（37分）
◇10月５日 ニンジニアスタジアム 3,372人 【得点】 [愛媛] 内村（62分）
◇９月27日 鳴門・大塚スポーツパークポカリスエットスタジアム 11,897人 【得点】 [徳島] 石田（18分、81分）、麦田（60分）、菅原（70分）、大西（84分）
◇９月23日 広島ビッグアーチ 19,349人 【得点】 [広島] 佐藤寿（25分）、服部（35分）、森崎浩（52分）、青山（62分） [愛媛] 横谷（87分）
