高知ファイティングドッグスは今季、最多勝（17勝）と最多奪三振（116個）の２冠に輝いた西川徹哉、最優秀防御率（1.05）と最多セーブ（22Ｓ）のタイトルを獲得した上里田光正の両投手と、リーグ初年度に首位打者となり、今季は一塁手のベストナインを受賞した林真輝外野手が退団すると発表した。いずれも本人の希望によるもの。西川は別の独立リーグで、上里田は社会人野球でNPBへの挑戦を続ける意向。真輝の進路は未定。
四国・九州アイランドリーグは2008年シーズンの年間MVPとベストナイン、後期MVPを発表した。 年間MVPは３連覇を果たした香川オリーブガイナーズから、前期MVPに輝き、30日のドラフト会議で東京ヤクルトより育成指名を受けた塚本浩二投手に決定。後期MVPには優勝した愛媛から大島慎伍外野手が選ばれた。ベストナインは福岡ソフトバンクから育成指名を受けた堂上隼人捕手(香川）と、智勝二塁手（香川）の２選手が３年連続で受賞した（智勝は07シーズンは遊撃手で選出）。
30日に都内で行われたNPBドラフト会議で四国・九州アイランドリーグからは育成選手を含めて６名が指名を受けた。オリックスが５巡目で西川雅人（愛媛）、福岡ソフトバンクが６巡目でキム・ムヨン(福岡）を獲得。育成枠で東京ヤクルトが塚本浩二、東北楽天が丈武、千葉ロッテが生山裕人、ソフトバンクが堂上隼人（いずれも香川）を指名した。
運命のドラフト会議が30日15時から都内で開かれる。１年目に２名、２年目に３名、３年目は６名（いずれも育成含む）と計11名のNPBプレーヤーを輩出してきたアイランドリーグ。今年のドラフトは社会人ナンバーワン右腕の田澤純一（新日本石油ENEOS）がメジャーリーグ挑戦を表明し、有力選手が少ないとの声もある。それだけに“隠し球”としてリーグの選手たちが指名を受ける可能性が高まってきた。
日本独立リーグ・グランドチャンピオンシップ2008は28日、最終第５戦が行われ、四国・九州アイランドリーグチャンピオンの香川オリーブガイナーズがＢＣリーグチャンピオンの富山サンダーバーズを延長11回の末、３−２で下し、２年連続の日本一に輝いた。香川はホームで連勝後、富山で連敗を喫したが、最終戦では終盤まで２点ビハインドの劣勢をひっくり返した。
四国・九州アイランドリーグは28日に千葉マリンスタジアムで行われる千葉ロッテ２軍との交流試合に出場するリーグ選抜チームのメンバーを発表した。選抜チームの監督は愛媛・沖泰司監督が務める。独立リーググランドチャンピオンシップに臨んでいる香川の選手は選ばれず、残り５球団からの18選手による編成となった。
日本独立リーグ・グランドチャンピオンシップ2008は26日、第４戦が行われ、四国・九州アイランドリーグチャンピオンの香川オリーブガイナーズはＢＣリーグチャンピオンの富山サンダーバーズに０−４で敗れ、２勝２敗のタイに並ばれた。両チーム無得点で迎えた８回、香川は守備のミスも絡んで４点を失う。攻撃も富山先発の田中孝次にわずか４安打で完封を許した。
日本独立リーグ・グランドチャンピオンシップ2008は25日、第３戦が行われ、四国・九州アイランドリーグチャンピオンの香川オリーブガイナーズはＢＣリーグチャンピオンの富山サンダーバーズに１敗を喫した。香川は序盤から守備にミスが出て富山に試合の主導権を握られ、そのまま最後まで流れを引き寄せることができなかった。
千葉ロッテマリーンズは秋季練習中の千葉マリンスタジアムで、２軍メンバーが独立リーグの選抜チームと練習試合を実施すると発表した。四国・九州アイランドリーグ選抜は28日（火）に試合を行う（26、27日はＢＣリーグ選抜が対戦）。試合開始は14時予定。30日のドラフト会議を直前に控え、リーグの選手たちにとっては最後のアピールの場となる。
宮崎で行われているフェニックス・リーグに参加している四国・九州アイランドリーグ選抜は22日、東京ヤクルトと対戦した。リーグ選抜は初回、ヤクルト・三輪正義（元香川）の内野安打をきっかけに１点を先行される。さらに４回も三輪のヒットを含む６安打を浴びて５点を失い、０−６で敗れた。
宮崎で行われているフェニックス・リーグに参加している四国・九州アイランドリーグ選抜は21日、巨人と対戦した。リーグ選抜は初回、フェニックス・リーグ絶好調の真輝のタイムリーで１点を先行。中盤に逆転を許したものの、４点を追う８回、陽耀華（福岡）が満塁の走者一掃の３塁打を放つなど、一挙６点をあげて逆転に成功する。その後の巨人の反撃を１点に抑えたリーグ選抜は、７−６で勝利した。
四国・九州アイランドリーグは2009シーズンの入団選手採用を目的としたトライアウトを11月８日より神戸、高知、福岡と首都圏（場所未定）の４カ所で実施すると発表した。昨年は四国、九州と首都圏の３カ所でトライアウトを行ったが、今年は関西での開催も決まった。15歳以上（2009年４月１日現在）の男子で義務教育を修了している選手であれば、誰でも受験可能。
日本独立リーグ・グランドチャンピオンシップ2008は18日、第２戦が行われ、第１戦を制した四国・九州アイランドリーグチャンピオンの香川オリーブガイナーズが３−１でＢＣリーグチャンピオンの富山サンダーバーズを下し、連勝で王手をかけた。香川は１−１の同点で迎えた７回、ホームスチールなどで２点を勝ち越し。投げては松尾晃雅が６回からロングリリーフで富山の反撃を許さず、接戦を制した。
今年の独立リーグ王者を決定する「日本独立リーグ・グランドチャンピオンシップ2008」が17日、香川・サーパススタジアムで開幕した。第１戦は四国・九州アイランドリーグチャンピオンの香川オリーブガイナーズ先発・塚本浩二とＢＣリーグチャンピオンの富山サンダーバーズ先発・小山内大和の投手戦となった。香川は４回、金井雄一郎の犠飛などで３点を先制。このリードを塚本から松尾晃雅とつないで守り、３−０で初戦を制した。
宮崎で行われているフェニックス・リーグに参加している四国・九州アイランドリーグ選抜は16日、千葉ロッテと対戦した。序盤は互いにゼロ行進が続いたが、５回、ロッテに根元俊一の３ランなどで一挙５点を奪われる。リーグ選抜はロッテ３番手としてマウンドに上がった小林憲幸（元徳島）を攻め、長崎準平の２ランで反撃する。しかし、以降は得点をあげられず２−６で敗れた。
宮崎で行われているフェニックス・リーグに参加している四国・九州アイランドリーグ選抜は13日、埼玉西武と対戦した。西武はクライマックスシリーズに向け、片岡易之、栗山巧、中島裕之、中村剛也、石井義人、ボカチカら主力メンバーが並ぶスタメン。リーグ選抜は３回、真輝（高知）の６試合連続打点となるタイムリーなどで２点を先行する。ところが、３回には片岡のソロで１点を返されると、４回には中村のタイムリー２塁打で逆転を許す。７回にはチャンスの場面できっちり中島に犠飛をあげられるなど、リードを広げられ、リーグ選抜は２−６で敗れた。
宮崎で行われているフェニックス・リーグに参加している四国・九州アイランドリーグ選抜は12日、北海道日本ハムと対戦した。リーグ選抜は３回、洋輔（香川）の２試合連続となるタイムリーで１点を先行。４回にも１点を追加したリーグ選抜は５回、真輝（高知）の２試合連続となるソロホームランが飛び出す。投げても６投手の継投で日本ハム打線を１失点に抑え、４−１で勝利した。
宮崎で行われているフェニックス・リーグに参加している四国・九州アイランドリーグ選抜は11日、東京ヤクルトと対戦した。リーグ選抜は初回、真輝（高知）の２ランなどで３点を先制する。直後に同点に追いつかれたものの、３回にも真輝がタイムリー２塁打を放ち、勝ち越し。６回には洋輔、７回は丈武（いずれも香川）が好機にヒットを打って得点を追加し、７−３で勝利した。
宮崎で行われているフェニックス・リーグに参加している四国・九州アイランドリーグ選抜は９日、巨人と対戦した。リーグ選抜は初回、巨人先発の木佐貫洋の立ち上がりを突き、中村竜央（高知）の３ランなどで一挙５点を先行する。１点差に詰め寄られた４回には、真輝（高知）の３試合連続打点となる犠飛などで３点を追加。このリードを継投で守りきり、８−４で今リーグの初勝利をおさめた。
宮崎で行われている秋季教育リーグ（フェニックス・リーグ）に参加している四国・九州アイランドリーグ選抜は８日、北海道日本ハムと対戦した。リーグ選抜は真輝（高知）が２本のタイムリーを放つなど、一時は４−１とリードしたが、５回に１点、６回に３点を失って逆転を許す。リーグ選抜は終盤、毎回走者を出しながらホームベースが遠く、４−５で敗れた。
NPB12球団と四国・九州アイランドリーグ選抜チーム、韓国の斗山ベアーズが参加する秋季教育リーグ（フェニックス・リーグ）が７日開幕し、アイランドリーグ選抜は初戦で東北楽天と対戦した。リーグ選抜は４回までに５点を奪って、試合を優位に進めたものの、８回に５点を失って同点に追いつかれる。直後に勝ち越したが、９回に再び追いつかれ、７−７で引き分けた。
四国・九州アイランドリーグは７日から宮崎で行われる秋季教育リーグ（フェニックス・リーグ）に出場するアイランドリーグ選抜の開幕時メンバー24名を発表した。リーグチャンピオンシップが早期終了したため、選手は全６球団から選ばれた。監督は高知の定岡智秋監督が９日まで務め、11日からは香川・西田真二監督、16日からは愛媛・沖泰司監督、21日からは福岡・森山良二監督がチームの指揮を執る。これに伴って選手も随時入れ替えを実施する。
四国・九州アイランドリーグの2008シーズン年間総合優勝を争うリーグチャンピオンシップは４日、第３戦が行われ、２連勝で王手をかけていた香川オリーブガイナーズ（前期優勝）が愛媛マンダリンパイレーツ（後期優勝）を破り、負けなしで３年連続の年間王者に輝いた。香川はＢＣリーグ王者とのグランドチャンピオンシップ（18日〜）で、次は２年連続の独立リーグ日本一を目指す。
福岡レッドワーブラーズと長崎セインツの混成チームが１日、福岡ソフトバンクホークス（２軍）とヤフードームで交流試合を行った。福岡・長崎は初回にエラーがらみで４点を奪われると、攻撃陣がソフトバンクの小刻みな投手リレーの前に４安打無得点に封じ込まれ、結局０−５で敗れた。なお、ソフトバンクでは元愛媛の西山道隆が５番手でマウンドに上がり、28日の長崎戦に続いて無失点で登板を終えている。
徳島インディゴソックスは30日、神戸遠征を行い、サーパス（オリックス２軍）と交流試合を行った。徳島は初回に１点を先行し、３回には山口寛史のタイムリーで追加点をあげる。一度は同点に追いつかれたものの、６回に相手のバッテリーミスで１点を勝ち越すと、８回は５安打を集中させて一挙７点を奪い、試合を決めた。投手陣も10安打をサーパスに浴びながら要所を締め、終わってみれば10−４。昨年７月に続いて、サーパスから白星をあげた。
